Così come gli altri terzi capitoli di ogni generazione, Pokémon Smeraldo non presenta versioni beta poiché si basa su dei giochi già pre-esistenti quali Rubino e Zaffiro.
Gli unici cambiamenti di cui siamo a conoscenza sono quelli effettuati, nel corso della realizzazione, alle varie strutture del Parco Lotta.
Cambiano poche cose rispetto a Rubino e Zaffiro: sono presenti le musiche di Rosso Fuoco e Verde Foglia oltre ad una mappa vuota inutilizzata denominata “Zona Speciale“, inserita tra i dati delle mappe di Kanto e quelle del Settipelago. Si pensa che questa zona fosse stata programmata per un probabile evento, per poi essere scartata completamente dal gioco.
