A differenza degli altri giochi della serie precedenti a questo, il Pokémon iniziale non sarà scelto in base ad un quiz, bensì verrà deciso da uno schermo di selezione; a seconda della versione posseduta, i Pokémon iniziali saranno differenti.
Pokémon Mystery Dungeon: Keep Going! Blazing Adventure Squad!
| Sprite | Pokémon |
|---|---|
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#004 Charmander |
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#037 Vulpix |
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#058 Growlithe |
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#133 Eevee |
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#155 Cyndaquil |
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#216 Teddiursa |
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#255 Torchic |
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#390 Chimchar |
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#427 Buneary |
Pokémon Mystery Dungeon: Let’s Go! Stormy Adventure Squad!
| Sprite | Pokémon |
|---|---|
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#007 Squirtle |
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#158 Totodile |
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#194 Wooper |
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#231 Phanpy |
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#258 Mudkip |
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#298 Azurill |
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#360 Wynaut |
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#393 Piplup |
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#447 Riolu |
Pokémon Mystery Dungeon: Go For It! Light Adventure Squad!
| Sprite | Pokémon |
|---|---|
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#025 Pikachu |
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#052 Meowth |
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#054 Psyduck |
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#172 Pichu |
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#175 Togepi |
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#179 Psyduck |
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#239 Elekid |
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#403 Shinx |
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#417 Pachirisu |