Pokémon non ottenibili

In Pokémon Cristallo, come in Pokémon Oro e Pokémon Argento, non è possibile ottenere tutti Pokémon necessari al completamento del Pokédex. Di seguito è presente una lista di Pokémon non ottenibili. La maggior parte sono ottenibili scambiandoli da Pokémon Rosso, Blu, Giallo, Oro e Argento, mentre i restanti sono ottenibili solo tramite evento.

#N Pokémon
#001 Bulbasaur
#002 Ivysaur
#003 Venusaur
#004 Charmander
#005 Charmeleon
#006 Charizard
#007 Squirtle
#008 Wartortle
#009 Blastoise
#037 Vulpix
#038 Ninetales
#056 Mankey
#057 Primeape
#138 Omanyte
#139 Omastar
#140 Kabuto
#141 Kabutops
#144 Articuno
#145 Zapdos
#146 Moltres
#150 Mewtwo
#151 Mew
#179

Mareep

#180 Flaaffy
#181 Ampharos
#213 Girafarig
#223 Remoraid
#224 Octilerry
#251 Celebi (Ottenibile solo in Giappone)