In Pokémon Cristallo sarà possibile incontrare durante il proprio viaggio dei personaggi con i quali scambiare i propri Pokémon. Ecco, di seguito, la lista degli scambi nel gioco:
Onix per Bellsprout
| Pokémon | Tipo | Pokémon richiesto | Luogo | Strumento tenuto |
|---|---|---|---|---|
 #095 Onix |
  |
 Bellsprout |
Violapoli | Bacca Amara |
Machop per Drowzee
| Pokémon | Tipo | Pokémon richiesto | Luogo | Strumento tenuto |
|---|---|---|---|---|
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#066 Machop |
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 Drowzee |
Fiordoropoli | Bacca Oro |
Voltorb per Krabby
| Pokémon | Tipo | Pokémon richiesto | Luogo | Strumento tenuto |
|---|---|---|---|---|
 #100 Voltorb |
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 Krabby |
Olivinopoli | Baccantiparalisi |
Dodrio per Dragonair♀
| Pokémon | Tipo | Pokémon richiesto | Luogo | Strumento tenuto |
|---|---|---|---|---|
 #085 Dodrio |
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Dragonair (F) |
Ebanopoli | Bacca Amara |
Xatu per Haunter
| Pokémon | Tipo | Pokémon richiesto | Luogo | Strumento tenuto |
|---|---|---|---|---|
 #178 Xatu |
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Haunter |
Plumbeopoli | Bacca Misteriosa |
Magneton per Haunter
| Pokémon | Tipo | Pokémon richiesto | Luogo | Strumento tenuto |
|---|---|---|---|---|
 #082 Magneton |
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 Haunter |
Centrale Elettrica | Bacca Misteriosa |
Aerodactyl per Chansey
| Pokémon | Tipo | Pokémon richiesto | Luogo | Strumento tenuto |
|---|---|---|---|---|
 #142 Aerodactyl |
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 Chansey |
Percorso 14 | Bacca Oro |