Molti dei Pokémon presenti in Pokémon Link: Battle! hanno ricevuto delle nuove abilità speciali.
Queste sono state impostate per la specie del Pokémon e non possono essere modificate.
| Abilità | Effetto | Pokémon |
|---|---|---|
| Trasformazione | Può essere allineato a qualunque Pokémon |  |
| Ricarica | Restituisce energia all’area di gioco |    |
| Attacco Stop | Paralizza temporaneamente il Pokémon selvatico |                 |
| Forza Cinque | Aumenta i danni inflitti da una combinazione di 5 Pokémon |                          |
| Forza Sei | Aumenta i danni inflitti da una combinazione di 6 Pokémon |              |
| Fissapareti | Ripara la parete dell’area di gioco |    |
| Forza latente | Aumenta i danni inflitti se l’energia è meno della metà |                         |
| Forza bruta | Infligge danni normali anche se il tipo è poco efficace |    |