Come per ogni coppia di videogiochi della serie principale, anche per Pokémon Oro HeartGold e Argento SoulSilver si parla di Pokémon esclusivi, che in altre parole si possono trovare solo in una delle due Versioni:
Pokémon esclusivi di Pokémon Oro HeartGold
| # | Sprite | Nome | Tipo |
|---|---|---|---|
| #056 |  |
Mankey |  |
| #057 |  |
Primeape | |
| #058 |  |
Growlithe |  |
| #059 |  |
Arcanine | |
| #138 |  |
Omanyte |   |
| #139 |  |
Omastar | |
| #167 |  |
Spinarak |   |
| #168 |  |
Ariados | |
| #207 |  |
Gligar |   |
| #226 |  |
Mantine | |
| #231 |  |
Phanpy | |
| #232 |  |
Donphan | |
| #302 |  |
Sableye |   |
| #343 |  |
Baltoy |  |
| #344 |  |
Claydol | |
| #347 |  |
Anorith | |
| #348 |  |
Armaldo | |
| #382 |  |
Kyogre | |
| #458 |  |
Mantyke | |
| #472 |  |
Gliscor | |
Pokémon esclusivi di Pokémon Argento SoulSilver
| # | Sprite | Nome | Tipo |
|---|---|---|---|
| #037 |  |
Vulpix | |
| #038 |  |
Ninetales | |
| #052 |  |
Meowth |  |
| #053 |  |
Persian | |
| #140 |  |
Kabuto | |
| #141 |  |
Kabutops | |
| #165 |  |
Ledyba | |
| #166 |  |
Ledian | |
| #216 |  |
Teddiursa | |
| #217 |  |
Ursaring | |
| #225 |  |
Delibird |  |
| #227 |  |
Skarmory |  |
| 303 |  |
Mawile | |
| #316 |  |
Gulpin | |
| #317 |  |
Swalot | |
| #345 |  |
Lileep |  |
| #346 |  |
Cradily | |
| #383 |  |
Groudon | |